药师琉璃光如来本愿功德经讲记目次
　　悬论
　　一　叙缘起………………………………………………………1──5
　　二　释经题…………………………………………………… 5──19
　　三　明翻译……………………………………………………19──24
　　正释
　　甲一 缘起分…………………………………………………25──46
　　乙一 叙事证信……………………………………………………25
　　乙二 礼请起说……………………………………………………36
　　甲二 正宗分……………………………………………… 46──192
　　乙一 如来开示……………………………………………………46
　　丙一 依正行愿…………………………………………………46
　　丁一 总标依正………………………………………………46
　　丁二 别陈行愿………………………………………………49
　　戊一 行愿…………………………………………………49
　　己一 总说………………………………………………49
　　己二 别叙………………………………………………52
　　庚一 生佛平等愿……………………………………52
　　庚二 开晓事业愿……………………………………55
　　庚三 无尽资生愿……………………………………58
　　庚四 安立大道愿……………………………………59
　　庚五 戒行清净愿……………………………………62
　　庚六 诸根具足愿……………………………………64
　　庚七 身心康乐愿……………………………………68
　　庚八 转女成男愿……………………………………70
　　庚九 回邪归正愿……………………………………72